Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP11BQ9Y2G3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP11BQ9Y2G3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms