Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ADAM28Q9UKQ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ADAM28Q9UKQ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms