Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS29Q9UBQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS29Q9UBQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms