Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMT1Q9NXH9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms