Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM100Q9NV29 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM100Q9NV29 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM100Q9NV29 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms