Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB6Q9NP58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB6Q9NP58 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB6Q9NP58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms