Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NSD3Q9BZ95 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NSD3Q9BZ95 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD3Q9BZ95 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms