Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PACSIN1Q9BY11 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN1Q9BY11 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACSIN1Q9BY11 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms