Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RETNLBQ9BQ08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms