Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GBP4Q96PP9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms