Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF560Q96MR9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF560Q96MR9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF560Q96MR9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms