Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VSIG2Q96IQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG2Q96IQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms