Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGBD4Q96DM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD4Q96DM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD4Q96DM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms