Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM18Q96B42 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM18Q96B42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms