Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP31Q70CQ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP31Q70CQ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
USP31Q70CQ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP31Q70CQ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP31Q70CQ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP31Q70CQ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP31Q70CQ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms