Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L3Q6VB84 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L3Q6VB84 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L3Q6VB84 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms