Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMED8Q6PL24 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMED8Q6PL24 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMED8Q6PL24 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms