Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAMD5Q5TGI4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms