Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC122Q5T0U0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC122Q5T0U0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC122Q5T0U0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms