Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD4Q53EL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms