Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEN1Q17RS7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms