Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NCOA1Q15788 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NCOA1Q15788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCOA1Q15788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NCOA1Q15788 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
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