Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 22.1
NOLC1Q14978 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.796e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.876e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.686e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.256e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-215ENST00000576917 1958 ntTSL 516.08■□□□□ 0.166e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-207ENST00000574671 1678 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.026e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.176e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-214ENST00000576544 1720 ntTSL 513.55□□□□□ -0.246e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 ACTG1-212ENST00000576209 1698 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.296e-15■■■■□ 22
NOLC1Q14978 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-69■■■■□ 22
NOLC1Q14978 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.913e-12■■■■□ 22
NOLC1Q14978 CKS1B-206ENST00000474215 739 ntTSL 312.23□□□□□ -0.453e-12■■■■□ 22
NOLC1Q14978 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-12■■■■□ 22
NOLC1Q14978 TAF1D-219ENST00000534079 656 ntTSL 27.1□□□□□ -1.271e-323■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 DNMT1-215ENST00000588913 1775 ntTSL 519.57■□□□□ 0.727e-9■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 DNMT1-207ENST00000586588 3094 ntTSL 216.07■□□□□ 0.167e-9■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.077e-9■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.067e-9■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.087e-9■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 DNMT1-225ENST00000591798 521 ntTSL 39.3□□□□□ -0.927e-9■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 LAPTM4A-202ENST00000483117 487 ntTSL 24.92□□□□□ -1.622e-7■■■■□ 21.9
NOLC1Q14978 LINC01089-206ENST00000537157 479 ntTSL 225.35■■□□□ 1.651e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)23.24■■□□□ 1.311e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 521.6■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 LINC01089-201ENST00000428029 1024 ntTSL 220.9■□□□□ 0.941e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)20.83■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 520.57■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 RGL2-245ENST00000491168 2316 ntTSL 220.55■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)19.94■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 LINC01089-210ENST00000543167 1059 ntTSL 219.04■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 RGL2-243ENST00000483151 2772 ntTSL 218.22■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 RGL2-238ENST00000437840 2687 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 LINC01089-208ENST00000541694 875 ntTSL 216.41■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 STAT2-207ENST00000556539 3278 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 TTC17-207ENST00000525543 3142 ntTSL 26.64□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 TTC17-212ENST00000533072 2607 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.511e-6■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-8■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 GLYR1-207ENST00000587936 897 ntTSL 515□□□□□ -0.012e-8■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-8■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-8■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 GLYR1-210ENST00000589389 3606 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.222e-8■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 GLYR1-209ENST00000588732 3527 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.542e-8■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.774e-31■■■■□ 21.8
NOLC1Q14978 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.056e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.416e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.296e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.166e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.026e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.976e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-21■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.876e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-21■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.526e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CECR7-201ENST00000414401 546 ntTSL 417.85■□□□□ 0.456e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 517.83■□□□□ 0.446e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.366e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 213.82□□□□□ -0.26e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CECR7-203ENST00000609596 2283 ntTSL 513□□□□□ -0.336e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CNNM4-204ENST00000496186 748 ntTSL 310.76□□□□□ -0.696e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.066e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.182e-16■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.396e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.536e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.566e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.926e-6■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 LINC02001-201ENST00000592381 1298 ntTSL 216.43■□□□□ 0.226e-51■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-51■■■■□ 21.7
NOLC1Q14978 EEF2-207ENST00000600794 352 ntTSL 310.07□□□□□ -0.85e-19■■■■□ 21.6
NOLC1Q14978 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-21■■■■□ 21.6
NOLC1Q14978 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.187e-7■■■■□ 21.6
NOLC1Q14978 SLC16A1-202ENST00000429288 865 ntTSL 312.92□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 SLC16A1-205ENST00000478835 452 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 SLC16A1-203ENST00000443580 1099 ntTSL 310.68□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-10■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-211ENST00000540697 829 ntTSL 219.67■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-208ENST00000537290 869 ntTSL 518.83■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 ACSF3-209ENST00000537895 550 ntTSL 48.84□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC8.63□□□□□ -1.031e-323■■■■□ 21.5
NOLC1Q14978 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.748e-8■■■■□ 21.4
NOLC1Q14978 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.518e-8■■■■□ 21.4
NOLC1Q14978 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.48e-8■■■■□ 21.4
NOLC1Q14978 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.368e-8■■■■□ 21.4
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