Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MDC1Q14676 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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