Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFIAQ12857 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIAQ12857 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIAQ12857 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
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