Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 MMS21YEL019C 804 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 NCS6YGL211W 1080 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YHR140WYHR140W 720 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 GEP5YLR091W 882 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 TAF4YMR005W 1167 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YNR040WYNR040W 771 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 PDR18YNR070W 4002 nt6.62□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 CDC19YAL038W 1503 nt6.61□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YDL119CYDL119C 924 nt6.61□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YEL074WYEL074W 339 nt6.61□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 MRPL24YMR193W 777 nt6.61□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 VMS1YDR049W 1899 nt6.6□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 PGK1YCR012W 1251 nt6.6□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 DON1YDR273W 1098 nt6.6□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.6□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YJL171CYJL171C 1191 nt6.6□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 MNN5YJL186W 1761 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 VRP1YLR337C 2454 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 ARO10YDR380W 1908 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 RPR2YIR015W 435 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YJU2YKL095W 837 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 CBT1YKL208W 816 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 AMD1YML035C 2433 nt6.59□□□□□ -1.35
CLF1Q12309 YIL092WYIL092W 1902 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 FLC3YGL139W 2409 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 PAN6YIL145C 930 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 MRS1YIR021W 1092 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 MRPL22YNL177C 930 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YPR123CYPR123C 435 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 MRPL36YBR122C 534 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RIO1YOR119C 1455 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 GLE1YDL207W 1617 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 APE3YBR286W 1614 nt6.58□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 SEC18YBR080C 2277 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 ALT1YLR089C 1779 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 AAP1YHR047C 2571 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 CDC10YCR002C 969 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YDL114WYDL114W 927 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 TRP1YDR007W 675 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 HAP2YGL237C 798 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RRP4YHR069C 1080 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YNR048WYNR048W 1182 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 NDJ1YOL104C 1059 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 PRE2YPR103W 864 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RNR3YIL066C 2610 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 CDS1YBR029C 1374 nt6.57□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 GUS1YGL245W 2127 nt6.56□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 GAT1YFL021W 1533 nt6.56□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YJU3YKL094W 942 nt6.56□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 CSC1YLR241W 2349 nt6.56□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 GIT1YCR098C 1557 nt6.56□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 SIT1YEL065W 1887 nt6.56□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 CNE1YAL058W 1509 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 NOP7YGR103W 1818 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 PFK2YMR205C 2880 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YER186CYER186C 921 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 LSM12YHR121W 564 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RPE1YJL121C 717 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 SSP120YLR250W 705 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 DSE3YOR264W 1293 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RPS9AYPL081W 594 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 ECM2YBR065C 1095 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 TAH18YPR048W 1872 nt6.55□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YME1YPR024W 2244 nt6.54□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RGD1YBR260C 2001 nt6.54□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 NOP2YNL061W 1857 nt6.54□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YHL017WYHL017W 1599 nt6.54□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 LYS12YIL094C 1116 nt6.54□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 NPA3YJR072C 1158 nt6.54□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 CTR1YPR124W 1221 nt6.54□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YGR022CYGR022C 330 nt6.53□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RPL10YLR075W 666 nt6.53□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 TAF11YML015C 1041 nt6.53□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YML6YML025C 861 nt6.53□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 RSA4YCR072C 1548 nt6.53□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 YDR109CYDR109C 2148 nt6.53□□□□□ -1.36
CLF1Q12309 ATG18YFR021W 1503 nt6.52□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YCL065WYCL065W 369 nt6.52□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 PPM1YDR435C 987 nt6.52□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 STB5YHR178W 2232 nt6.52□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 SCT1YBL011W 2280 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 FOB1YDR110W 1701 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 RHB1YCR027C 630 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YRA1YDR381W 681 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YER010CYER010C 705 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 RAD3YER171W 2337 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 AVO1YOL078W 3531 nt6.51□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 BRL1YHR036W 1416 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YPK2YMR104C 2034 nt6.5□□□□□ -1.37
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