Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 ADY2YCR010C 852 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 RHB1YCR027C 630 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 QNS1YHR074W 2145 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 EFM4YIL064W 774 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YML6YML025C 861 nt5.79□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF2Q12221 DRS1YLL008W 2259 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YIL055CYIL055C 1884 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 HXT17YNR072W 1695 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 CEF1YMR213W 1773 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 STB5YHR178W 2232 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 NAT5YOR253W 531 nt5.78□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 ACS1YAL054C 2142 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YME1YPR024W 2244 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YDL023CYDL023C 321 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 RPL10YLR075W 666 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 TFB4YPR056W 1017 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 VNX1YNL321W 2727 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 RSM23YGL129C 1353 nt5.77□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 RSC30YHR056C 2652 nt5.77□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF2Q12221 PIC2YER053C 903 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YGL118CYGL118C 438 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 SKG1YKR100C 1068 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 RPN7YPR108W 1290 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YDR514CYDR514C 1452 nt5.76□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YMR027WYMR027W 1413 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 TRP1YDR007W 675 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 PPM1YDR435C 987 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YHR140WYHR140W 720 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 ARG1YOL058W 1263 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 MLC2YPR188C 492 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 MRPL36YBR122C 534 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 ICE2YIL090W 1476 nt5.75□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF2Q12221 YEL020CYEL020C 1683 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 EMW1YNL313C 2715 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 IES1YFL013C 2079 nt5.75□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YEH1YLL012W 1722 nt5.74□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF2Q12221 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 CDS1YBR029C 1374 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 MSS1YMR023C 1581 nt5.74□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 CDC10YCR002C 969 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 CBT1YKL208W 816 nt5.73□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 APM4YOL062C 1476 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 HIR1YBL008W 2523 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 YIL077CYIL077C 963 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 MRS3YJL133W 945 nt5.72□□□□□ -1.49 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR194CYLR194C 765 nt5.72□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 DPB2YPR175W 2070 nt5.71□□□□□ -1.49
PUF2Q12221 VPS5YOR069W 2028 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 HCR1YLR192C 798 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 GFD1YMR255W 567 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 RBD2YPL246C 789 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 SMF2YHR050W 1650 nt5.71□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF2Q12221 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 BRL1YHR036W 1416 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 RAP1YNL216W 2484 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 BUL1YMR275C 2931 nt5.71□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 VHT1YGR065C 1782 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YDL034WYDL034W 345 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 TAF11YML015C 1041 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YBL081WYBL081W 1107 nt5.7□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF2Q12221 CWC25YNL245C 540 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YPR150WYPR150W 522 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 GUA1YMR217W 1578 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YDL057WYDL057W 987 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 SSK22YCR073C 3996 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 SHE10YGL228W 1734 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 QDR3YBR043C 2070 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YAP1801YHR161C 1914 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 MID1YNL291C 1647 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 AIM41YOR215C 558 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 COA2YPL189C-A 207 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 CNM67YNL225C 1746 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 MRC1YCL061C 3291 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 PAT1YCR077C 2391 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 ATG7YHR171W 1893 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 COX26YDR119W-A 201 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 RPL7AYGL076C 735 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 SYN8YAL014C 768 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 COS9YKL219W 1224 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 RPL7BYPL198W 735 nt5.67□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF2Q12221 VPS72YDR485C 2388 nt5.67□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF2Q12221 PCS60YBR222C 1632 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 ARO10YDR380W 1908 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 MSS116YDR194C 1995 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 GIR2YDR152W 798 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 CAD1YDR423C 1230 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 MMS21YEL019C 804 nt5.66□□□□□ -1.5
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