Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 RPS28AYOR167C 204 nt5.71□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 RPN7YPR108W 1290 nt5.71□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 PRP24YMR268C 1335 nt5.71□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 PXL1YKR090W 2121 nt5.71□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 MCM3YEL032W 2916 nt5.71□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 NUP1YOR098C 3231 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 UGO1YDR470C 1509 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 AFG1YEL052W 1530 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 HAS1YMR290C 1518 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 LEU5YHR002W 1074 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 COX17YLL009C 210 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 ZRT2YLR130C 1269 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SEC17YBL050W 879 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 YNR040WYNR040W 771 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 FHL1YPR104C 2811 nt5.7□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 YOL036WYOL036W 2286 nt5.69□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 PYK2YOR347C 1521 nt5.69□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SET5YHR207C 1581 nt5.69□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 ARP1YHR129C 1155 nt5.69□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 ARH1YDR376W 1482 nt5.69□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 WTM1YOR230W 1314 nt5.69□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 CNE1YAL058W 1509 nt5.69□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 YPL245WYPL245W 1365 nt5.68□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 HOS1YPR068C 1413 nt5.68□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 EFM3YJR129C 1020 nt5.68□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SPC42YKL042W 1092 nt5.68□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 PHB1YGR132C 864 nt5.67□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SSK1YLR006C 2139 nt5.66□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 VPS5YOR069W 2028 nt5.66□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 ENV7YPL236C 1095 nt5.66□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 PRI2YKL045W 1587 nt5.66□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 ADE12YNL220W 1302 nt5.66□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 MTC5YDR128W 3447 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 VNX1YNL321W 2727 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 ALT2YDR111C 1524 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 KEL1YHR158C 3495 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 GPT2YKR067W 2232 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 COX20YDR231C 618 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 IPK1YDR315C 846 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 RPE1YJL121C 717 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 YJU3YKL094W 942 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 MRPS5YBR251W 924 nt5.65□□□□□ -1.5
NMD4Q12129 VPS4YPR173C 1314 nt5.65□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 BZZ1YHR114W 1902 nt5.64□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 LDB19YOR322C 2457 nt5.64□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 HST4YDR191W 1113 nt5.64□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 RPN11YFR004W 921 nt5.64□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 YOL035CYOL035C 303 nt5.64□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 YDR132CYDR132C 1488 nt5.64□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 RAD3YER171W 2337 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 HAP2YGL237C 798 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 SPG1YGR236C 288 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 SPO12YHR152W 522 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 RPR2YIR015W 435 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 CCP1YKR066C 1086 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 RBA50YDR527W 1320 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 YFL042CYFL042C 2025 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 MET7YOR241W 1647 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 PCS60YBR222C 1632 nt5.63□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 FOB1YDR110W 1701 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 FRE7YOL152W 1863 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 SIT4YDL047W 936 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 PCL6YER059W 1263 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 DJP1YIR004W 1299 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 VMA4YOR332W 702 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 DUG1YFR044C 1446 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 MUM3YOR298W 1440 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 CLB2YPR119W 1476 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 GAT1YFL021W 1533 nt5.62□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 LYS21YDL131W 1323 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 NSI1YDR026C 1713 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 YER186CYER186C 921 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 MRPL25YGR076C 474 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 GTO1YGR154C 1071 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 MPM1YJL066C 759 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 ADD37YMR184W 597 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 UBC11YOR339C 471 nt5.61□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 MRC1YCL061C 3291 nt5.6□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 MMS21YEL019C 804 nt5.6□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 SNN1YNL086W 309 nt5.6□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 RPC19YNL113W 429 nt5.6□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 VRP1YLR337C 2454 nt5.6□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 YPK2YMR104C 2034 nt5.6□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 PKC1YBL105C 3456 nt5.59□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 XBP1YIL101C 1944 nt5.59□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 ECM19YLR390W 339 nt5.59□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 OSW5YMR148W 447 nt5.59□□□□□ -1.51
NMD4Q12129 HSP78YDR258C 2436 nt5.59□□□□□ -1.51
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