Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN11Q06124 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN11Q06124 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms