Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLOD1Q02809 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLOD1Q02809 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms