Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5Q00535 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5Q00535 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5Q00535 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5Q00535 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5Q00535 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5Q00535 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5Q00535 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5Q00535 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5Q00535 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5Q00535 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5Q00535 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5Q00535 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5Q00535 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5Q00535 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5Q00535 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5Q00535 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5Q00535 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5Q00535 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5Q00535 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5Q00535 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5Q00535 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5Q00535 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5Q00535 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5Q00535 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms