Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF2IP78347 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2IP78347 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2IP78347 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms