Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC1P62191 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC1P62191 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms