Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNFP41002 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNFP41002 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNFP41002 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNFP41002 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNFP41002 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNFP41002 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNFP41002 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNFP41002 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNFP41002 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNFP41002 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNFP41002 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNFP41002 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNFP41002 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNFP41002 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNFP41002 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNFP41002 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNFP41002 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNFP41002 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNFP41002 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNFP41002 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNFP41002 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNFP41002 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNFP41002 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNFP41002 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNFP41002 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNFP41002 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNFP41002 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNFP41002 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNFP41002 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNFP41002 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNFP41002 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNFP41002 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNFP41002 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNFP41002 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNFP41002 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNFP41002 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNFP41002 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNFP41002 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNFP41002 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNFP41002 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNFP41002 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms