Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB4P28070 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB4P28070 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms