Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SDSP20132 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDSP20132 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDSP20132 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDSP20132 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDSP20132 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDSP20132 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDSP20132 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDSP20132 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDSP20132 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDSP20132 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDSP20132 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDSP20132 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDSP20132 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDSP20132 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDSP20132 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDSP20132 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SDSP20132 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDSP20132 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDSP20132 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDSP20132 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDSP20132 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDSP20132 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDSP20132 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDSP20132 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDSP20132 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDSP20132 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDSP20132 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDSP20132 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SDSP20132 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDSP20132 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDSP20132 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDSP20132 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SDSP20132 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDSP20132 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDSP20132 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDSP20132 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDSP20132 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDSP20132 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDSP20132 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SDSP20132 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SDSP20132 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SDSP20132 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SDSP20132 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SDSP20132 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SDSP20132 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDSP20132 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDSP20132 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDSP20132 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDSP20132 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDSP20132 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDSP20132 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDSP20132 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SDSP20132 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDSP20132 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SDSP20132 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SDSP20132 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SDSP20132 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SDSP20132 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SDSP20132 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SDSP20132 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SDSP20132 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDSP20132 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDSP20132 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDSP20132 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SDSP20132 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDSP20132 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDSP20132 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDSP20132 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDSP20132 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms