Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD8P13378 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD8P13378 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD8P13378 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms