Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM228BP0C875 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM228BP0C875 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms