Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTAP01040 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTAP01040 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTAP01040 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTAP01040 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTAP01040 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTAP01040 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTAP01040 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTAP01040 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTAP01040 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTAP01040 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTAP01040 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTAP01040 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTAP01040 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTAP01040 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTAP01040 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTAP01040 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTAP01040 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTAP01040 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTAP01040 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTAP01040 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTAP01040 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTAP01040 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTAP01040 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTAP01040 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTAP01040 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTAP01040 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTAP01040 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTAP01040 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTAP01040 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTAP01040 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTAP01040 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTAP01040 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTAP01040 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTAP01040 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTAP01040 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTAP01040 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTAP01040 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTAP01040 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSTAP01040 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSTAP01040 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTAP01040 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTAP01040 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTAP01040 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTAP01040 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTAP01040 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTAP01040 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTAP01040 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTAP01040 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms