Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM1O75626 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM1O75626 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms