Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MITFO75030 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MITFO75030 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MITFO75030 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MITFO75030 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MITFO75030 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MITFO75030 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MITFO75030 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MITFO75030 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MITFO75030 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MITFO75030 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MITFO75030 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MITFO75030 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MITFO75030 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MITFO75030 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MITFO75030 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MITFO75030 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MITFO75030 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MITFO75030 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MITFO75030 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MITFO75030 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MITFO75030 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MITFO75030 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MITFO75030 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MITFO75030 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MITFO75030 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MITFO75030 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MITFO75030 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MITFO75030 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MITFO75030 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MITFO75030 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MITFO75030 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MITFO75030 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MITFO75030 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MITFO75030 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MITFO75030 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MITFO75030 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms