Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF113AO15541 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF113AO15541 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF113AO15541 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms