Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
SUPT5HO00267 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
SUPT5HO00267 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SUPT5HO00267 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms