Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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