Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXND1Q9Y4D7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms