Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3AQ9Y2H6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3AQ9Y2H6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms