Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA2Q9UL42 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNMA2Q9UL42 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms