Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD3Q9UJU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms