Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDAP2Q9NXN4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDAP2Q9NXN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms