Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRAK4Q9NWZ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRAK4Q9NWZ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms